Насчет налогов и учета в РПЦ, как человек, который видел базы 1С (нелицензионные, кстати) в некоторых так скажем "учреждений РПЦ" немного поясню.
1. Налоги (НДС/недвижимость/прибыль и т.п.) действительно не платят. Налоги по 69 счету (с заработной платы в фонды пенсионный/соцстрах/медстрах) платят + 13% НДФЛ тоже платят. Другое дело у них толком никто не принят на работу. Максимум Настоятель + послушник/послушница в качестве главного бухгалтера.
2. Отчетность ведется и в налоговую сдается. Примерно по принципу НКО (некоммерческих организаций). Помимо этого "наверх" сдается что-то вроде отчета о прибылях и убытках. На основании него, я так понимаю, и определяется сумма, которую надо отправить вышестоящей организации, но за это 100% не ручаюсь.
3. Некоторые "учреждения" даже умудряются использовать стандартную 1С-Бухгалтерию для ведения учета. И даже учитывают приход подаяний. В целом в базе обычно полный трэш - ну, к примеру, материалы, которые использовались в строительстве с отрицательным остатком - в порядке вещей.
ЗЫ: Помогал несколько раз паре таких "учреждений", было это давно (и неправда), деньги за консультации ни разу не брал (может зря?)