Горячее
Лучшее
Свежее
Подписки
Сообщества
Блоги
Эксперты
Войти
Забыли пароль?
или продолжите с
Создать аккаунт
Я хочу получать рассылки с лучшими постами за неделю
или
Восстановление пароля
Восстановление пароля
Получить код в Telegram
Войти с Яндекс ID Войти через VK ID
Создавая аккаунт, я соглашаюсь с правилами Пикабу и даю согласие на обработку персональных данных.
ПромокодыРаботаКурсыРекламаИгрыПополнение Steam
Пикабу Игры +1000 бесплатных онлайн игр
«Дурак подкидной и переводной» — классика карточных игр! Яркий геймплей, простые правила. Развивайте стратегию, бросайте вызов соперникам и станьте королем карт! Играйте прямо сейчас!

Дурак подкидной и переводной

Карточные, Настольные, Логическая

Играть

Топ прошлой недели

  • Rahlkan Rahlkan 1 пост
  • Tannhauser9 Tannhauser9 4 поста
  • alex.carrier alex.carrier 5 постов
Посмотреть весь топ

Лучшие посты недели

Рассылка Пикабу: отправляем самые рейтинговые материалы за 7 дней 🔥

Нажимая кнопку «Подписаться на рассылку», я соглашаюсь с Правилами Пикабу и даю согласие на обработку персональных данных.

Спасибо, что подписались!
Пожалуйста, проверьте почту 😊

Помощь Кодекс Пикабу Команда Пикабу Моб. приложение
Правила соцсети О рекомендациях О компании
Промокоды Биг Гик Промокоды Lamoda Промокоды МВидео Промокоды Яндекс Директ Промокоды Отелло Промокоды Aroma Butik Промокоды Яндекс Путешествия Постила Футбол сегодня
0 просмотренных постов скрыто
26
vlv85
vlv85
3 года назад

Антикризисная пайка светодиодных лент жадюг по имени LG & подстава от JML/Ali⁠⁠

Антикризисная пайка светодиодных лент жадюг по имени LG & подстава от JML/Ali Пайка, Левша, На коленке, Ремонт телевизоров, Первый пост

1. Имеем ТВ LG, обладающий славой выгорающих лент подсветки. Жадные бизнесмены LG дают на них большую силу тока (ток уменьшил, отпаяв 1 резюк в регулирующей параллели).
Симптом: звук есть, изображения нет, но если светить в экран фонариком, то изображение проявляется.
Разобрал ТВ, нашёл неисправные светики.

2. Заказывал на али светодиодные ленты 16 мая со склада в РФ, зависло в службе доставки IML 19 мая. IML обанкротилась вроде. Должно было прийти 21 мая. Сегодня 9 июня.

3. Плюнул, купил 6 светиков и перепаял их на свечи ХD))). У лент сильный теплоотвод, метод утюга не справляется, термофена нет. Закрепил в тисках стальную пластину, подобрал зазор, достаточный для пайки без перегрева и вуаля. Выпаял-впаял, собрал, всё работает ))).

ПС: процесс разборки- сборки не снимал, полно роликов почти для всех моделей ТВ, вот свечку никто не использовал пока.

Назад, в эпоху каменного века, к простым инструментам, копьям и кострам!

Показать полностью 1
[моё] Пайка Левша На коленке Ремонт телевизоров Первый пост
12
3526
ArtZUZU
ArtZUZU
3 года назад

Когда реально сделано на коленке!!!⁠⁠

Это просто гениально!!!

Театр Юмор Вертикальное видео Видео Спектакль Мим Фокус Колено На коленке
41
JohnKabriel
JohnKabriel
3 года назад

Аналогия пальца и непальца⁠⁠

Аналогия пальца и непальца
Мемы На коленке
3
2477
Shelma19
Shelma19
3 года назад
LEGO

Когда твой парень обожает Лего⁠⁠

Пришла домой с работы, заметила на рабочем столе сию заготовку. Подумала..О! Какой мой парень молодец, мастерит какую-то фигурку по своему проекту. А вечером он мне показывает ее истинное назначение)

И вроде гордость берет, и вроде рукалицо))

Собрал мой парень Игорь, 32 годика.

[моё] LEGO Самоделки Конструктор Инженер На коленке Гордость Приложение Кликер Юмор Видео Мат Вертикальное видео Cookie-clicker
396
0
gakanani
gakanani
3 года назад

Написала недо-рассказ-недо-фанфик для сообщения⁠⁠

Задали нам сделать сообщение на тему "Каким вы представляете худ. образ определённой эпохи"

Ну, а я что, подумала-погуглила и примеров никаких не нашла. Решила забить, написать фанфик и проанализировав его составить образ. Из эпох выбрала средневековье, ибо манхву я в этом стиле просто обожаю. Вот что у меня получилось:

Красивые дома вокруг этой столичной улицы, ветерок освежает и наполняет меня свежей энергией. Мой рыцарь идёт за мной, меня переполняют эмоции, сегодня будет мой первый выход в свет! Это очень важный день для любого дворянина, как-никак первый выход в светское общество. В ближайший год мне следует обзавестись подругами-аристократками. Незаметно я погрузилась в свои мысли и перестала замечать что-либо вокруг, кроме волнения.

-Мисс Жизель! – послышался голос сзади. Это был глас Дитриха Лагранжа – моего рыцаря. На секунду я замешкалась, оглянулась на него и поняла, что падаю.

*Шух*

Послышался глухой звук упавшей леди. Почему глухой? Леди была одета в однотонное зелёное платье, с длиной юбкой, рюшами и множеством подъюбников, модное по тем временам. Конкретно последние и задержали звук падения.

Все звуки, что я слышала, исчезли. Пение молодых скворцов, гул ветра, гуляющего между улицами, шуршание листьев, суета города. Всё пропало, вокруг лишь одна темнота. Неожиданно для себя, я поняла, что тут вовсе не темно, мои ладони видны, а платье всё такое же – зелёное. Я, как бы, левитировала в пустоте.

Панике моей не было придела. Я оглядывалась, кричала, звала на помощь. Не знаю, сколько времени я провела в этом состоянии. Я кое-как успокоилась, послышалось не громкое пение. Оно было буквально божественно, мне казалось, будто со стороны, в которой оно доносится, наплывает туман. Голубовато-белый, красивый и с запахом храма. Когда он приблизился настолько, что низ моей юбки начал расплываться в нежнейшем бирюзовом, послышался тихий глас божий.

-Жизель Эвклид… Жизель Эвклид…

Он будто звал меня, я начала тщательно вслушиваться в звуки, происходящие вокруг. И, наконец, произнесла:

-Кто вы? Где я? Как я тут оказалась?

-Дитя моё… Выслушай же бога своего, покровителя судьбы - Дердевелера. Ты – одна из тех, кто получил моё богославление и можешь стать первой из священнослужителей моей церкви! Ты получишь уважение моё и смертных, святые силу и землю! Тебе нужно лишь принять веру мою и заповеди мои, дитя.

Я, будучи под эффектом от всего сказанного и окружающего меня, кивнула, в знак согласия.

-Но есть одно «но», Жизель… Если ты не прибудешь в храм мой до затмения солнечного, то я не смогу даровать тебе и кусочка своих безмерных сил… Тебе надо будет лишь прибыть в резиденцию……

-Жизель!!!

Кто-то коснулся меня, я слышала плачь, а голос покровителя моего – исчез. Свет, он проступал сквозь мои веки, такие тяжёлые, что открыть их не удавалось даже с помощью всей задействованной мной силы. Что уж говорить о более серьёзных движениях… Я по-прежнему слышала плачь, сейчас я могла его узнать – это моя мать, чувственная женщина. Она всегда за меня переживала, ведь боги не наделили меня крепким здоровьем, думаю, что она беспокоилась ещё и о том, что я вряд ли смогу родить будущему мужу наследника.

Мне, в конце концов, уже почти 16 лет, скоро наступит совершеннолетие, а у меня, из-за скверного здоровья, не было ни одного приёма, что уж говорить о дебюте в высшем обществе или политическом опыте… Всё это было не важно для меня в тот момент, более я хотела как-либо успокоить матушку. Спустя долгие и мучительно сложные попытки раскрыть глаза, или сказать что-то у меня наконец получилось.

Моя нижняя губа двинулась, мама сразу заметила это и была явно взволнована, она перестала издавать какие-либо звуки, прерываясь иногда на то, чтобы высморкаться. Я же начала стараться ещё сильнее, с желанием успокоить мою мать – Герду Эвклид.

Когда я окончательно очнулась, то узнала, что упала в обморок, когда направлялась в кафе-салон своей давней подруги, леди Габарета Джуфи. В отключке я была более недели, и родители уже начали терять надежду, что я когда-либо проснусь. Доктора и священнослужители стали говорить, что мне уже не помочь, но, когда я двинула губой два дня назад, они изменили своё мнение.

За эту неделю я очень исхудала, мне хотелось пить, моя жажда не унималась. Я была бледна и не похожа сама на себя. Около трёх месяцев меня не выпускали из поместья, полтора месяца из которых я восстанавливала здоровье, а за неделю относительного здравия я успела подхватить сильную простуду и лечилась оставшееся время.

Всё, вроде как, пришло в норму, но меня сильно интересовало, что за бог мне покровительствует, ведь я, по верованию, христианка. Я много времени провела в семейной библиотеке, но не смогла ничего найти про «Дердавелера – бога судьбы». Вероятно, он мог упоминаться в более древних писаниях, к которым у меня не было доступа.

Прошло 4 месяца с дебюта, которого так и не произошло. У меня совсем мало времени освоиться в светском обществе, а когда мне исполниться 16, я уже должна буду выбирать графа, а если повезёт, маркиза в мужья. Жена к моменту свадьбы должна быть освоившейся в светском обществе, образованной и мудрой женщиной, которая могла бы приглядеть за поместьем и контролировать слуг.

Я твёрдо решила дебютировать в этом месяце. Как раз приближался праздник, на банкете в честь которого я могла бы представиться высшему свету. Я попросила моего учителя по этикету быть строже со мной, ведь идеальные манеры – это то, что может помочь улучшить первое впечатление о человеке. Да и какая приличная дама хочет вести себя неподобающе в глазах высшего общества? Я, и то, что обо мне подумают, может изменить судьбу рода.

Судьбу… и снова я вспоминаю Дердевелера. Может быть мне стоит попросить его о благосклонности к удаче? Я очень хочу, чтобы мой дебют прошёл идеально.

В последние два дня перед отъездом я молилась Дердевелеру, чтобы он был более мягок со мной в эти, несомненно важные, дни. Вот, я сажусь в карету, чувствуя удачу, дарованную мне моим покровителем. На мне прекрасное жёлтое платье, оно простоватое, но смотрится с моими тёмными волосами и серыми глазами, на удивление, идеально. Все мои аксессуары подобраны в цвет платья и о внешнем виде я не беспокоилась ни чуть.

Мы ехали около двух часов, наконец прибыв во дворец, где, собственно и проходил банкет, посвящённый этому дню.

По началу мой дебют казался мне идеальным, но вскоре я поняла, что всё происходящее вокруг – полная чепуха и неудача для меня. Каждая аристократка посчитала своим долгом оскорбить меня, мой наряд и манеры. Но я не поняла причину этому. Со мной всё было в порядке, мои манеры были отточены до совершенства, а внешний вид тщательно продуман.

Я очень быстро покинула банкет, даже не станцевав ни одного танца, ссылаясь на то, что появились неотложные дела. По прибытии домой, я убежала в свою комнату и расплакалась, ведь нет мне места в будущем, никто ни возьмёт такую, как я, в жёны. Я останусь последней носительницей крови Евклид и умру несчастной смертью, как нелюбимая никем женщина.

Я не заметила, как уснула и снова очутилась в той странной пустоте, с красивым голубоватого цвета туманом, в которой повстречала своего покровителя. Я была зла, измучена и несчастна. Я кричала в эту пустоту, обвиняла в том, что он не смог даровать мне счастье и удачу. И вот, мне ответили.

-Благословлённое мной дитя, прими судьбу, ты обратилась к моей помощи слишком поздно…

Он успокаивал меня, подбадривал и, наконец, предложил:

-Дитя, всё ещё можно исправить, ты моешь стать моей жрицей! Жрицей, что будет оберегать всех священнослужителей, что благословлены мною, богом судьбы – Дердавелером. Ты согласна, дитя моё, Жизель Евклид?

Снова, будто под гипнозом, я кивнула.

-Тебе придётся покинуть свою семью на некоторое время, для того, чтобы быть посвящённой в верховные жрицы! Отправляйся на восток, не сворачивай в другую сторону, ты сразу поймёшь какой храм тебе нужен...

Я снова проснулась, моя голова болела очень сильно и не хотела жалеть свою владелицу. По ощущению я проспала всю жизнь, но на самом деле это был всего лишь день. Последний мой благополучный день, как я узнала в последствии.

Я сбежала из дома в ту же ночь, оделась максимально неприметно и начала двигаться к востоку. Не знаю, что такое на меня нашло, безысходность, быть может, хотя, уже и не важно. Я шла быстрым шагом сквозь небольшой лес, энергии моей не было придела. По щекам текли слёзы, я была одурманена божеством.

К восходу солнца я уже приблизилась к городу, но я не знала, стоит ли туда заходить. Всё-таки решившись, я зашла в город.

Тут началась моя бедная жизнь, я не знаю, искали ли меня родители, я не знала, сколько дней, а может и недель прошло. Изо дня в день я скиталась по этому маленькому городу, ища пищу. Я не могла отправиться дальше из-за нехватки драгоценных еды и воды.

Я воровала, питалась отходами, кое-как сводила концы с концами. Я хотела вернуться в моё комфортное поместье, но у меня не хватило бы сил добраться назад. И вот, в очередную беспокойную ночь он пришёл – Дердевалер. Я снова, как по щелчку пальцев, оказалась в пустоте, наполненной туманом, который с каждым разом становился всё более голубым, нежели белым.

-Дердевелер! Бог мой, покровитель! За что мне всё это? У меня нет сил и энергии даже на то, чтобы найти себе пищу…

-Дитя, двигайся к востоку, там мой храм есть, сейчас он заброшен, но там есть много еды и ключик с питьевой водой. Там ты будешь в безопасности...

И снова свет окутал меня, снова день и снова моё доверие к богу очнулось. Я начала ковылять на восток. Каждый проходящий мимо боялся меня, я была крайне истощенна, бледна и грязна. Я больше не выглядела как дворянка, у меня нет и гроша.

Когда мои силы полностью иссякли я увидела его, полуразрушенный храм, небольшой, но нет смердящего запаха гнили, только приятный запах храма и тот самый туман, что окружал меня в пустоте. Из последних сил я вошла в него и вновь оказалась в пустоте.

-Дитя моё! Ты смогла, ты в моём храме! Ох, как прекрасно, как прекрасно!!! Тебе остаётся лишь провести отряд посвящения в жрицу, и ты можешь остаться в этом укромном уголке на ВСЮ жизнь. Возьми свечи, составь их в ряд, но, перед тем, как зажечь их, воспользуйся порошком из цветка незабудки. Прочитай молитву мне и дай клятву.

Я не могла ничего ответить, просто кивнула, очнулась на полу в его храме. Нашла свечи, составила в ряд, параллельно я увидела ступку и засохшие незабудки. Измельчила все, до последнего лепестка. Начала посыпать и читать молитву, которую я сама никогда не слышала, вероятно он послал её глубоко в кору моего одурманенного мозга.

Я прошла вокруг свеч около 10-ти кругов. И начала их зажигать, всё так же читая молитву и произнося последнее «Дердевалер», как вдруг меня схватили сзади.

-Именем церкви мне придётся вас захватить! Вы будете обвинены в измене церкви и Христу Господу, а после казнены.

В темнице никто не слушал меня и мои оправдания. Для них я была уже мертвецом. Я плакала ночи напролёт и вот, наконец, ко мне пришло осознание. Дердевалер одурманил меня, вероятно туманом. Я и правда нагрешила, отказалась от Христа Господа в пользу злосчастному богу несчастья. Он был именно им, богом несчастья. Если бы я не поверила ему, то мой дебют прошёл бы удачно и всё было бы хорошо, а сейчас, меня уже собирают на эшафот, где на меня оденут петлю.

Уже стоя на эшафоте, за секунды до смерти, последними словами Жизель Эвклид, 15-ти летней девушки, стали:

-Дердевалер, будь ты проклят!


интересный факт: всё это было написано за четыре часа, надеюсь учитель оценит.

Показать полностью
[моё] Длиннопост Фантастический рассказ Проект На коленке Текст
1
3
vanzitar
3 года назад

Празник уже близко⁠⁠

Красное&Белое Очередь Заправка Coca-Cola На коленке Видео
2
299
wasser63
3 года назад
Рукодельники

Декоративная полка своими руками⁠⁠

Вот и закончил полочку. Материал - липа. Сделано на кухонном столе и коленках. Лобзик ручной. Резьба стамеской и ножом. Шарики и балясинки сделаны на микротокарном самодельном станочке по вечерам. В конце шлифовка, грунтовка ПВА, акриловая перламутровая эмаль VGT универсал.

Декоративная полка своими руками Самоделки, Работа с деревом, Изделия из дерева, Декор, На коленке, Рукоделие без процесса
[моё] Самоделки Работа с деревом Изделия из дерева Декор На коленке Рукоделие без процесса
31
5
DELETED
3 года назад

МЕДВЕДИ, ХОМЯКИ, ЧЕЛОВЕКОПОДОБНЫЕ. ХОМЯК ИЛИ МЕДВЕДЬ БРАТ ЧЕЛОВЕКУ С ТОЧКИ ЗРЕНИЯ БИОИНФОРМАТИКИ?⁠⁠

Чтобы ответить на этот вопрос, в научном исследовании необходимо определиться с целью, задачами и методами, и изучаемыми материалами. Для этого нужно постараться предварительно поставить гипотезу, которая облегчит нам понимание того, чего мы хотим, а следовательно, позволит нам выбирать материалы исследования.

МЕДВЕДИ, ХОМЯКИ, ЧЕЛОВЕКОПОДОБНЫЕ. ХОМЯК ИЛИ МЕДВЕДЬ БРАТ ЧЕЛОВЕКУ С ТОЧКИ ЗРЕНИЯ БИОИНФОРМАТИКИ? Биоинформатика, Биотехнологии, Молекулярная кухня, Молекулярная генетика, Молекулярная биология, Эволюционная биология, Генетика, Эволюция, Медведи, Хомяк, Люди, Обезьяна, Тюлень, Интересное, Познавательно, На коленке, Собрано на коленке, Гены, Гениально, ДНК, Длиннопост

В качестве гипотезы можно опираться на ваши знания в области классификации групп животных. Однако, если у Вас нет таких знаний и Вы не хотите страдать в поисках этих знаний в полях, лесах и лабораториях, то Вы можете стать продвинутым пользователем интернета и воспользоваться удобном сайтом lifemap [1], который отображает филогенетическое древо всех животных. Если же вы не продвинутый пользователь, то Вы можете просто воспользоваться википедией. Стоит отметить, что для учёного сайт Lifemap является таким же примитивным, как и википедия, но не бойтесь начать с малого, ведь википедия может послужить толчком к эволюции от простого к сложному. Поэтому пойдёмте эволюционировать на вики вместе. Для этого зайдём в поисковик и посмотрим информацию о нужных нам группах, с которыми в будущем нам предстоит работать, на данном сайте. Первые в списке у нас медвежьи. На странице сайта нам не нужно досконально изучать строение, размножение и образ жизни медведей. Нам нужны три вещи:

МЕДВЕДИ, ХОМЯКИ, ЧЕЛОВЕКОПОДОБНЫЕ. ХОМЯК ИЛИ МЕДВЕДЬ БРАТ ЧЕЛОВЕКУ С ТОЧКИ ЗРЕНИЯ БИОИНФОРМАТИКИ? Биоинформатика, Биотехнологии, Молекулярная кухня, Молекулярная генетика, Молекулярная биология, Эволюционная биология, Генетика, Эволюция, Медведи, Хомяк, Люди, Обезьяна, Тюлень, Интересное, Познавательно, На коленке, Собрано на коленке, Гены, Гениально, ДНК, Длиннопост

Переходим в раздел научной классификации и смотрим список родов в семействе медведей, предварительно выписав название этого семейства на латыни (Ursidae). Нам понадобятся названия всех родов на латыни, которые есть в семействе. Их лучше также выписать (рис.1).

(рис.1)

МЕДВЕДИ, ХОМЯКИ, ЧЕЛОВЕКОПОДОБНЫЕ. ХОМЯК ИЛИ МЕДВЕДЬ БРАТ ЧЕЛОВЕКУ С ТОЧКИ ЗРЕНИЯ БИОИНФОРМАТИКИ? Биоинформатика, Биотехнологии, Молекулярная кухня, Молекулярная генетика, Молекулярная биология, Эволюционная биология, Генетика, Эволюция, Медведи, Хомяк, Люди, Обезьяна, Тюлень, Интересное, Познавательно, На коленке, Собрано на коленке, Гены, Гениально, ДНК, Длиннопост

После проделанной работы переходим в раздел филогенетики и выбираем кладу с ближайшими живыми родственниками в качестве запасного варианта.

Это нужно сделать на случай, если нужные генетические последовательности медведей из разных родов в генбанке нам найти не удастся (рис.2).

МЕДВЕДИ, ХОМЯКИ, ЧЕЛОВЕКОПОДОБНЫЕ. ХОМЯК ИЛИ МЕДВЕДЬ БРАТ ЧЕЛОВЕКУ С ТОЧКИ ЗРЕНИЯ БИОИНФОРМАТИКИ? Биоинформатика, Биотехнологии, Молекулярная кухня, Молекулярная генетика, Молекулярная биология, Эволюционная биология, Генетика, Эволюция, Медведи, Хомяк, Люди, Обезьяна, Тюлень, Интересное, Познавательно, На коленке, Собрано на коленке, Гены, Гениально, ДНК, Длиннопост

Нам повезло, по альтернативной версии ближайшие родственники — это ластоногие. Выпишем название этой группы, выберем семейство и список родов аналогично медведям.

Теперь переходим в раздел краткой сводки научной классификации (рис.3). Находим вкладку «отряд хищные» и переходим по ней.

(рис.3)

МЕДВЕДИ, ХОМЯКИ, ЧЕЛОВЕКОПОДОБНЫЕ. ХОМЯК ИЛИ МЕДВЕДЬ БРАТ ЧЕЛОВЕКУ С ТОЧКИ ЗРЕНИЯ БИОИНФОРМАТИКИ? Биоинформатика, Биотехнологии, Молекулярная кухня, Молекулярная генетика, Молекулярная биология, Эволюционная биология, Генетика, Эволюция, Медведи, Хомяк, Люди, Обезьяна, Тюлень, Интересное, Познавательно, На коленке, Собрано на коленке, Гены, Гениально, ДНК, Длиннопост

Во вкладке отряда переходим в раздел 4.1. «Внешняя систематика». Там необходимо найти надотряд, к которому принадлежат медведи (рис.4). Он указан на филогенетическом древе в виде гиперссылки, нажимаем на неё и переходим в соответствующий раздел.

(рис.4)

МЕДВЕДИ, ХОМЯКИ, ЧЕЛОВЕКОПОДОБНЫЕ. ХОМЯК ИЛИ МЕДВЕДЬ БРАТ ЧЕЛОВЕКУ С ТОЧКИ ЗРЕНИЯ БИОИНФОРМАТИКИ? Биоинформатика, Биотехнологии, Молекулярная кухня, Молекулярная генетика, Молекулярная биология, Эволюционная биология, Генетика, Эволюция, Медведи, Хомяк, Люди, Обезьяна, Тюлень, Интересное, Познавательно, На коленке, Собрано на коленке, Гены, Гениально, ДНК, Длиннопост

В разделе нам нужно узнать отношение приматов к этому надотряду. Для этого мы переходим во вкладку «классификация» и как ни странно мы не обнаруживаем в нём приматов (рис.5) Получается, что медведи по версии википедии вообще не близкие родственники приматов. Может это так и есть, но кто же по версии википедии примату будет братом?

(рис.5)

МЕДВЕДИ, ХОМЯКИ, ЧЕЛОВЕКОПОДОБНЫЕ. ХОМЯК ИЛИ МЕДВЕДЬ БРАТ ЧЕЛОВЕКУ С ТОЧКИ ЗРЕНИЯ БИОИНФОРМАТИКИ? Биоинформатика, Биотехнологии, Молекулярная кухня, Молекулярная генетика, Молекулярная биология, Эволюционная биология, Генетика, Эволюция, Медведи, Хомяк, Люди, Обезьяна, Тюлень, Интересное, Познавательно, На коленке, Собрано на коленке, Гены, Гениально, ДНК, Длиннопост

Для этого проводим аналогичные манипуляции с семейством хомяковые и в конечном итоге попадаем в отряд грызуны. Переходим в раздел систематики и ищем надотряд (рис.6).

(рис.6)

МЕДВЕДИ, ХОМЯКИ, ЧЕЛОВЕКОПОДОБНЫЕ. ХОМЯК ИЛИ МЕДВЕДЬ БРАТ ЧЕЛОВЕКУ С ТОЧКИ ЗРЕНИЯ БИОИНФОРМАТИКИ? Биоинформатика, Биотехнологии, Молекулярная кухня, Молекулярная генетика, Молекулярная биология, Эволюционная биология, Генетика, Эволюция, Медведи, Хомяк, Люди, Обезьяна, Тюлень, Интересное, Познавательно, На коленке, Собрано на коленке, Гены, Гениально, ДНК, Длиннопост

Какое удивление! Мы в надотряде Euarchontoglires обнаружили людей! Чудесно. Ну, а теперь можно поставить гипотезу. Нашей гипотезой будет утверждение, что хомяковые являются братьями людей, а нашей целью подтвердить это утверждение. Для достижения цели нам необходимо поставить следующие задачи:

МЕДВЕДИ, ХОМЯКИ, ЧЕЛОВЕКОПОДОБНЫЕ. ХОМЯК ИЛИ МЕДВЕДЬ БРАТ ЧЕЛОВЕКУ С ТОЧКИ ЗРЕНИЯ БИОИНФОРМАТИКИ? Биоинформатика, Биотехнологии, Молекулярная кухня, Молекулярная генетика, Молекулярная биология, Эволюционная биология, Генетика, Эволюция, Медведи, Хомяк, Люди, Обезьяна, Тюлень, Интересное, Познавательно, На коленке, Собрано на коленке, Гены, Гениально, ДНК, Длиннопост

Чтобы уже начинать определяться с методами нам нужно выбрать внешнюю группу, а также определиться с генетическими последовательностями. Внешняя группа нам нужна для определения положения корня дерева, так сказать, его основы. В качестве внешней группы обычно используют одну или несколько клад, отпочковавшихся от общего дерева заведомо раньше (но желательно ненамного раньше) анализируемых последовательностей. Поскольку мы изучаем филогенетические отношения между плацентарными млекопитающими, то в качестве внешней группы можно использовать сумчатых млекопитающих [4]. Пусть это будут опоссумы. Я люблю опоссумов. Это котики мира сумчатых, а котиков любят все.


Далее определяем материалы. В качестве необходимых материалов я решил взять рибосомальные гены 18S рРНК у двух представителей разных родов из каждых изучаемых групп. Маркер 18S рРНК используется с конца 70-х годов прошлого столетия и является универсальным для систематических построений. Ген, кодирующий 18S рибосомную РНК, есть в геноме всех известных эукариот и является удобным маркером для их идентификации; он отсутствует у вирусов, бактерий и архей. Ген 18S рРНК содержит как консервативные участки, одинаковые у всех прокариот, так и вариабельные. Консервативные участки служат для первого этапа полимеразной цепной реакции – присоединения праймеров к исследуемой ДНК-матрице, вариабельные участки – для идентификации видов. Степень сходства видоспецифичных вариабельных участков отражает эволюционное родство разных видов [3].


С материалами более-менее определились, теперь их необходимо скачать в генетической базе данных. Переходим на сайт ген банка и в поисковой строке вбиваем название семейства латинскими буквами и ищем генетические последовательности родов, которые мы записывали ранее. Последовательности должны быть приблизительно равной длины и ни в коем случае не короткие, ибо короткие последовательности несут мало информации, а информация в нашей работе — это золото, где филогенетическое древо — Зиккурат. А всем мы знаем, что для строительства Зиккурата нужно больше золота. Поэтому для удобства в графе «Sequence length» выставим необходимую длину последовательностей (1600-2500) и нажмём кнопку «Search» (рис.7).

МЕДВЕДИ, ХОМЯКИ, ЧЕЛОВЕКОПОДОБНЫЕ. ХОМЯК ИЛИ МЕДВЕДЬ БРАТ ЧЕЛОВЕКУ С ТОЧКИ ЗРЕНИЯ БИОИНФОРМАТИКИ? Биоинформатика, Биотехнологии, Молекулярная кухня, Молекулярная генетика, Молекулярная биология, Эволюционная биология, Генетика, Эволюция, Медведи, Хомяк, Люди, Обезьяна, Тюлень, Интересное, Познавательно, На коленке, Собрано на коленке, Гены, Гениально, ДНК, Длиннопост

На рисунке выше мы видим, что я начал с медведей, к сожалению ген банк выдал мне всего три результата и все одного вида. Ничего страшного, ведь медведя мы всё равно скачаем, а запасной вариант в виде ластоногих (рис.8) у нас имеется и к счастью в генбанке необходимые последовательности по ним есть.

МЕДВЕДИ, ХОМЯКИ, ЧЕЛОВЕКОПОДОБНЫЕ. ХОМЯК ИЛИ МЕДВЕДЬ БРАТ ЧЕЛОВЕКУ С ТОЧКИ ЗРЕНИЯ БИОИНФОРМАТИКИ? Биоинформатика, Биотехнологии, Молекулярная кухня, Молекулярная генетика, Молекулярная биология, Эволюционная биология, Генетика, Эволюция, Медведи, Хомяк, Люди, Обезьяна, Тюлень, Интересное, Познавательно, На коленке, Собрано на коленке, Гены, Гениально, ДНК, Длиннопост

Таким образом мы скачиваем все необходимые нам последовательности в формате "fasta". Cкаченные последовательности закидываем по одной (или несколько, если Вы скачали всё одним форматом) в программу MEGA 10 для объединения в один формат «fasta» в будущем (рис.9)

МЕДВЕДИ, ХОМЯКИ, ЧЕЛОВЕКОПОДОБНЫЕ. ХОМЯК ИЛИ МЕДВЕДЬ БРАТ ЧЕЛОВЕКУ С ТОЧКИ ЗРЕНИЯ БИОИНФОРМАТИКИ? Биоинформатика, Биотехнологии, Молекулярная кухня, Молекулярная генетика, Молекулярная биология, Эволюционная биология, Генетика, Эволюция, Медведи, Хомяк, Люди, Обезьяна, Тюлень, Интересное, Познавательно, На коленке, Собрано на коленке, Гены, Гениально, ДНК, Длиннопост

Итак, в мою выборку исследования попали 8 видов. Я не буду пугать Вас латынью как делаю это обычно, а перечислю всех избранных товарищей по-русски «матом». Первые два вида в моём списке будут представлять этакую не существующую в реальном мире вершину эволюции и как Вы догадались это человекообразные обезьяны — человек и горилла. Вторыми по иерархии идут хомяковые — водяная полёвка и серый хомячок, третьими замыкающими внутреннюю группу идут медвежьи и настоящие тюлени — бурый медведь и длинномордый тюлень соответственно. Представляют внешнюю группу у меня два вида из разных родов опоссумов — виргинский и домовой опоссумы. Строить дерево мы будем в тренировочной программе MEGA 10


Теперь нам надо начинать определяться с методами. Первым важным методом будет выравнивание генетических последовательностей. Выравнивание является важным биоинформатическим методом, основанным на размещении двух или более генетических последовательностей позволяющим увидеть сходные участки в этих последовательностях. Их сходство может отображать структурные и эволюционные связи, которые без выравнивания не построить [5]. Выравнивание мы не будем производить в MEGA 10, так как для рибосомальных последовательностей лучше воспользоваться маффтом [6]. Перед этим мы объединим все последовательности в меге в одну и экспортируем в любую папку на рабочем столе в формате «fasta» (рис.10).

МЕДВЕДИ, ХОМЯКИ, ЧЕЛОВЕКОПОДОБНЫЕ. ХОМЯК ИЛИ МЕДВЕДЬ БРАТ ЧЕЛОВЕКУ С ТОЧКИ ЗРЕНИЯ БИОИНФОРМАТИКИ? Биоинформатика, Биотехнологии, Молекулярная кухня, Молекулярная генетика, Молекулярная биология, Эволюционная биология, Генетика, Эволюция, Медведи, Хомяк, Люди, Обезьяна, Тюлень, Интересное, Познавательно, На коленке, Собрано на коленке, Гены, Гениально, ДНК, Длиннопост

Сохранённый файл мы загружаем на сервер мафта в браузере (рис. 11) и изменим один стандартный параметр, выбрав тот, который показан на рисунке 12. Далее нажимаем кнопку «Submit» и получаем результат, который необходимо реформировать в формат fasta, как показано на рисунке 13.

МЕДВЕДИ, ХОМЯКИ, ЧЕЛОВЕКОПОДОБНЫЕ. ХОМЯК ИЛИ МЕДВЕДЬ БРАТ ЧЕЛОВЕКУ С ТОЧКИ ЗРЕНИЯ БИОИНФОРМАТИКИ? Биоинформатика, Биотехнологии, Молекулярная кухня, Молекулярная генетика, Молекулярная биология, Эволюционная биология, Генетика, Эволюция, Медведи, Хомяк, Люди, Обезьяна, Тюлень, Интересное, Познавательно, На коленке, Собрано на коленке, Гены, Гениально, ДНК, Длиннопост
МЕДВЕДИ, ХОМЯКИ, ЧЕЛОВЕКОПОДОБНЫЕ. ХОМЯК ИЛИ МЕДВЕДЬ БРАТ ЧЕЛОВЕКУ С ТОЧКИ ЗРЕНИЯ БИОИНФОРМАТИКИ? Биоинформатика, Биотехнологии, Молекулярная кухня, Молекулярная генетика, Молекулярная биология, Эволюционная биология, Генетика, Эволюция, Медведи, Хомяк, Люди, Обезьяна, Тюлень, Интересное, Познавательно, На коленке, Собрано на коленке, Гены, Гениально, ДНК, Длиннопост
МЕДВЕДИ, ХОМЯКИ, ЧЕЛОВЕКОПОДОБНЫЕ. ХОМЯК ИЛИ МЕДВЕДЬ БРАТ ЧЕЛОВЕКУ С ТОЧКИ ЗРЕНИЯ БИОИНФОРМАТИКИ? Биоинформатика, Биотехнологии, Молекулярная кухня, Молекулярная генетика, Молекулярная биология, Эволюционная биология, Генетика, Эволюция, Медведи, Хомяк, Люди, Обезьяна, Тюлень, Интересное, Познавательно, На коленке, Собрано на коленке, Гены, Гениально, ДНК, Длиннопост

Полученный формат необходимо загрузить обратно в мегу и уже работать в ней. Поздравляю мы это сделали! (рис.14)

МЕДВЕДИ, ХОМЯКИ, ЧЕЛОВЕКОПОДОБНЫЕ. ХОМЯК ИЛИ МЕДВЕДЬ БРАТ ЧЕЛОВЕКУ С ТОЧКИ ЗРЕНИЯ БИОИНФОРМАТИКИ? Биоинформатика, Биотехнологии, Молекулярная кухня, Молекулярная генетика, Молекулярная биология, Эволюционная биология, Генетика, Эволюция, Медведи, Хомяк, Люди, Обезьяна, Тюлень, Интересное, Познавательно, На коленке, Собрано на коленке, Гены, Гениально, ДНК, Длиннопост

Далее производим установление попарных эволюционных дистанций между анализируемыми последовательностями, представляемых в виде матрицы дистанций. Другими словами, для построения дерева нам требуется эволюционная модель, оптимального метода расчета эволюционных дистанций между последовательностями. В качестве статистического метода я воспользуюсь методом оценки дат дивергенции видов, который разрабатывался с точки зрения концепции молекулярных часов, а именно эволюционной моделью Hasegawa, Kishino и Yano 1985 года.


Данная модель различает скорость различных точечных мутаций и учитывает не равные базовые частоты, которые не учитываются простыми моделями [7]. В меге эту модель можно выбрать сразу при построении дерева в методе максимального правдоподобия, там же заранее выставим проверку в 1000 реплик (так называемый бустрэп анализ). Данный анализ позволяет посмотреть статистическую поддержку ветвей, чем она выше, тем будет лучше. Высокая поддержка большинства ветвей более 70% позволяет сказать, что дерево построено правильно (рис.15). Поддержка ниже 70% для одной, или двух ветвей не является очень критичной при низкой выборке, но, если мы получим статистическую поддержку всех ветвей ниже 70% это будет говорить об очень плохом результате.

МЕДВЕДИ, ХОМЯКИ, ЧЕЛОВЕКОПОДОБНЫЕ. ХОМЯК ИЛИ МЕДВЕДЬ БРАТ ЧЕЛОВЕКУ С ТОЧКИ ЗРЕНИЯ БИОИНФОРМАТИКИ? Биоинформатика, Биотехнологии, Молекулярная кухня, Молекулярная генетика, Молекулярная биология, Эволюционная биология, Генетика, Эволюция, Медведи, Хомяк, Люди, Обезьяна, Тюлень, Интересное, Познавательно, На коленке, Собрано на коленке, Гены, Гениально, ДНК, Длиннопост

К сожалению, посмотреть эту модель отдельно инструментал меги не позволяет, но наглядно она бы выглядела примерно таким образом (рис.16).

МЕДВЕДИ, ХОМЯКИ, ЧЕЛОВЕКОПОДОБНЫЕ. ХОМЯК ИЛИ МЕДВЕДЬ БРАТ ЧЕЛОВЕКУ С ТОЧКИ ЗРЕНИЯ БИОИНФОРМАТИКИ? Биоинформатика, Биотехнологии, Молекулярная кухня, Молекулярная генетика, Молекулярная биология, Эволюционная биология, Генетика, Эволюция, Медведи, Хомяк, Люди, Обезьяна, Тюлень, Интересное, Познавательно, На коленке, Собрано на коленке, Гены, Гениально, ДНК, Длиннопост

Данная модель разрабатывалась для построения деревьев методом максимального правдоподобия, который я по сути и выбрал.


Метод максимального правдоподобия, говоря примитивным языком, позволяет определить неизвестное число параметров на основании известных результатов эксперимента. Скажем, если известно число граней правильного многогранника (т.е. число параметров), то можно определить, чему равны вероятности различных исходов бросков этого многогранника. Так, для шестигранной игральной кости вероятность любого исхода броска будет равна 1/6. Однако если взять за гипотезу, что число граней некой игральной кости нам неизвестно, данный метод позволяет предположить путём многократных повторных экспериментов в виде бросков этой игральной кости, число граней этой кости и определить правдоподобие этого предположения. Так, многократно подбрасывая некую игральную кость с неизвестным числом граней и наблюдая, что число различных исходов бросков кости равно шести, можно сделать предположение, что это кость шестигранная [4]. Именно поэтому этот метод в данном случае я считаю одним из лучших для ответа на заданные мной вопросы.


В качестве дополнительных плюшек мега позволяет воспользоваться функциями уточнения выводимого дерева, что даёт нам возможность вывести исходное дерево для эвристического поиска, который в свою очередь используется для оценки лучшего состояния нашего дерева. Подробно, что такое эвристический поиск можно прочитать в IT сообществе хабр [5]. Итак, в дополнительных параметрах меги меге мы можем выбрать метод максимальной экономии, который является критерием оптимальности, для которого наилучшим считается самое короткое дерево, которое объясняет данные. Этот метод работает по канонам Бритвы Оккама (рис 17). В принципе в дополнительных параметрах можно выбрать ещё кучу всего, но я думаю и этого вполне хватит.

МЕДВЕДИ, ХОМЯКИ, ЧЕЛОВЕКОПОДОБНЫЕ. ХОМЯК ИЛИ МЕДВЕДЬ БРАТ ЧЕЛОВЕКУ С ТОЧКИ ЗРЕНИЯ БИОИНФОРМАТИКИ? Биоинформатика, Биотехнологии, Молекулярная кухня, Молекулярная генетика, Молекулярная биология, Эволюционная биология, Генетика, Эволюция, Медведи, Хомяк, Люди, Обезьяна, Тюлень, Интересное, Познавательно, На коленке, Собрано на коленке, Гены, Гениально, ДНК, Длиннопост

Собственно, теперь у нас всё готово, чтобы проверить википедию на подлинность и заодно нашу гипотезу. Строим дерево! (Рис.18) ;(Рис.19)

МЕДВЕДИ, ХОМЯКИ, ЧЕЛОВЕКОПОДОБНЫЕ. ХОМЯК ИЛИ МЕДВЕДЬ БРАТ ЧЕЛОВЕКУ С ТОЧКИ ЗРЕНИЯ БИОИНФОРМАТИКИ? Биоинформатика, Биотехнологии, Молекулярная кухня, Молекулярная генетика, Молекулярная биология, Эволюционная биология, Генетика, Эволюция, Медведи, Хомяк, Люди, Обезьяна, Тюлень, Интересное, Познавательно, На коленке, Собрано на коленке, Гены, Гениально, ДНК, Длиннопост
МЕДВЕДИ, ХОМЯКИ, ЧЕЛОВЕКОПОДОБНЫЕ. ХОМЯК ИЛИ МЕДВЕДЬ БРАТ ЧЕЛОВЕКУ С ТОЧКИ ЗРЕНИЯ БИОИНФОРМАТИКИ? Биоинформатика, Биотехнологии, Молекулярная кухня, Молекулярная генетика, Молекулярная биология, Эволюционная биология, Генетика, Эволюция, Медведи, Хомяк, Люди, Обезьяна, Тюлень, Интересное, Познавательно, На коленке, Собрано на коленке, Гены, Гениально, ДНК, Длиннопост

Вуаля — чувствую себя доктором ВУ, когда дерево строится успешно!


Теперь давайте взглянем, что у нас получилось, а получилось у нас практически всё идеально!


Как Вы сами видите построенное дерево рассказывает нам о том, что грызуны являются более близкими родственниками по отношению к людям и подтверждает нашу гипотезу, несмотря на то, что одна ветвь у нас имеет поддержку ниже 70%, что в принципе не является критичным, так как все остальные ветви имеют статистическую поддержку более 70%. Конечно я допускаю за собой маленькие ошибки в построении дерева, но общая картина была вполне ожидаема и показала всё то, что известно самому капитану очевидности и его капитанше. Действительно хомяк является «братом» человека, а медведь его дальним родственником, а теперь можно выдохнуть! Всего доброго!


Автор: Аномалокарис, биолог, вдохновитель сообщества Фанерозой, Ефимов Самир

МЕДВЕДИ, ХОМЯКИ, ЧЕЛОВЕКОПОДОБНЫЕ. ХОМЯК ИЛИ МЕДВЕДЬ БРАТ ЧЕЛОВЕКУ С ТОЧКИ ЗРЕНИЯ БИОИНФОРМАТИКИ? Биоинформатика, Биотехнологии, Молекулярная кухня, Молекулярная генетика, Молекулярная биология, Эволюционная биология, Генетика, Эволюция, Медведи, Хомяк, Люди, Обезьяна, Тюлень, Интересное, Познавательно, На коленке, Собрано на коленке, Гены, Гениально, ДНК, Длиннопост

1. http://lifemap.univ-lyon1.fr


2. https://www.ncbi.nlm.nih.gov/nuccore/?term=Phocidae%2018S%20...


3. Соловьева В.В. Молекулярно-генетический анализ беспозвоночных животных по нуклеотидной последовательности гена 18S рибосомной РНК: учебное пособие / Соловьева В.В., Моров А.Р., Ризванов А.А., Сабиров Р.М.- Казань: федеральный ун-т, 2011 – 52 с.


4. Молекулярная эволюция и филогенетический анализ/ В.В. Лукашов —М.БИНОМ. Лаборатория знаний, 2009. — с.256. с.92-123.


5. Mount DM. Bioinformatics: Sequence and Genome Analysis. — 2nd. — Cold Spring Harbor Laboratory Press: Cold Spring Harbor, NY., 2004.


6. https://mafft.cbrc.jp/alignment/server/

Hasegawa M., Kishino H., and Yano T. (1985). Dating the human-ape split by a molecular clock of mitochondrial DNA. Journal of Molecular Evolution 22:160-174.


7. https://habr.com/ru/company/mailru/blog/217839/

Показать полностью 22
[моё] Биоинформатика Биотехнологии Молекулярная кухня Молекулярная генетика Молекулярная биология Эволюционная биология Генетика Эволюция Медведи Хомяк Люди Обезьяна Тюлень Интересное Познавательно На коленке Собрано на коленке Гены Гениально ДНК Длиннопост
3
Посты не найдены
О нас
О Пикабу Контакты Реклама Сообщить об ошибке Сообщить о нарушении законодательства Отзывы и предложения Новости Пикабу Мобильное приложение RSS
Информация
Помощь Кодекс Пикабу Команда Пикабу Конфиденциальность Правила соцсети О рекомендациях О компании
Наши проекты
Блоги Работа Промокоды Игры Курсы
Партнёры
Промокоды Биг Гик Промокоды Lamoda Промокоды Мвидео Промокоды Яндекс Директ Промокоды Отелло Промокоды Aroma Butik Промокоды Яндекс Путешествия Постила Футбол сегодня
На информационном ресурсе Pikabu.ru применяются рекомендательные технологии